건본 산업대학원은 본교의 건학정신을 바탕으로 공학적 지식의 기반 위에서 전문기술 및 경영의 이론과 실제를 연구 교수하여 현대 산업사회에 적응토록 하며 산학협동을 통하여 기술과 사회문제를 광범위하게 깊이 다룰 수 있는 고급과학기술인 및 경영인을 양성하기 위하여 설립된 전문 특수대학원이다.
현재, 향장학과, 이미지산업학과, 골프산업학과, 방위사업학과, 의학물리융합학과, 생물공학과, 미래자동차공학과가 설치되어 있다.