생명공학의 학문적·산업적 응용분야와 범위는 대단히 넓고 다양하기 때문에, 졸업 후의 진로 역시 광범위합니다. 생명공학 관련 기업 (예:LG생명과학, 삼성정밀화학, SK케미칼, 녹십자, 종근당, 동아제약, 유한양행, CJ제일제당, 대상, 삼양, 두산, 진로, 태평양, 참존, 한국화장품, 한불화장품 등), 국공립 연구소 (예: 식품의약품안전처, 국립보건원, 생명공학연구원, 한국과학기술연구원, 국립독성화학연구원, 국립암센터, 원자력의학원 등) 국내외 제약회사 (예:광동제약, 대웅제약, 동국제약, 동아제약, 로슈, 보령제약, 부광약품, 삼성제약, 영진약품, 유한양행, 종근당 등) 및 주류 및 식품관련 기업에 취업하고 있습니다.

또한 많은 수의 학생들이 본교를 포함하는 전 세계 유명대학 및 대학원에서 보다 창의적이며 전문적인 연구를 위하여 진학하고 있으며 졸업 후 세계 각국에서 교육과 연구를 활발하게 진행하고 있습니다.

본과에 개설된 석·박사 과정 이수 후, 많은 수의 졸업생이 국내외 대학에서 전임교원으로서 강의와 연구를 진행 있으며, 이와는 별도로 본 학과의 교육과정은 MEET나 DEET를 통한 의학·치의학 전문대학원으로의 진학에 도움이 될 수 있도록 구성되어 있기 때문에 매년 일정한 수 이상의 학생이 의학 전문대학원에 진학하고 있습니다.