대학원 진학, 유학, 기업체 취직 등의 진로를 선택할 수 있다. 일반적으로 전문 연구소 취업의 경우 석사학위이상의 학력을 필요로 하며 일반 기업체의 경우도 대학원 졸업자의 선호도가 높아지고 있어 대학원 진학률이 높아지는 추세이다. 사회 진출의 경우 생명공학 관련분야를 선호하나, 그 영역은 제한되어 있지 않다. 이외에도 기술고시, 변리사 시험 등을 통하여 중앙 및 지방행정기관에 종사하기도 한다. 일부는 MEET(의학교육입문시험), DEET(치의학교육입문시험) 등을 통하여 의학계로 진출하기도 한다.

생명공학 관련 기업(의학, 제약, 신약개발, 화장품, 화장품소재개발. 식품 및 다양한 생물/화학 관련 업계 등), 생명공학 산업 지원기업(유전자, 유전체분석, bioinformatics, 진단 시약 및 시스템 개발 업계 등), 정부 및 기업 출연 연구소 (한국생명공학연구원, 한국화학연구원, 제약회사 연구소, 식품회사 연구소, 화장품 연구소, 바이오 벤처기업 등), 공무원(중앙정부 관련부처, 식품의약품 안전처, 질병관리본부, 국립수의과학검역원, 농촌진흥원 등), 바이오벤처 사업 창업 등 다양한 선택이 가능하다. 학업을 이어가고 싶은 경우, 학/석사를 마친 후 유학을 선택하거나 박사후 과정(post-doctoral course)을 거쳐서 교직 (대학교수)으로 진출하기도 한다.