自1959年作为建国大学文理学院科学系成立以来，该系在其半个世纪的历史中，基于大学的诚实、忠诚和正直的创立理念，运行专业化和差异化的教育项目。这些项目旨在培养能够为地区、国家甚至全球社会发展做出贡献的创新专家。该系在化学相关行业的发展中发挥了关键作用，已颁发了1300个本科学位、270个硕士学位和32个博士学位。

化学系目前由11名教授和4名荣休教授组成，共指导150名本科生和30名研究生。教授团队专长覆盖物理化学（3人）、有机化学（3人）、无机化学（2人）、分析化学（2人）和生物化学（2人），在韩国和国际上均享有学术卓越声誉。他们积极开展化学主要领域的基础和应用研究项目。该系从韩国国家研究基金会、首尔市议会和多个政府部门获得丰厚资金支持，几乎所有研究生作为研究助理或教学助理获得奖学金。

在1997年，建国大学化学系的液晶显示（LCD）研究小组被指定为G7项目的主要研究机构，旨在开发下一代平面显示设备，该项目得到了商业、工业与能源部以及前科学技术部的支持。自那时起，该小组一直在进行高速液晶的研究，这被视为21世纪LCD行业的“下一个重大事物”，研究人员在韩国领先的LCD企业中发挥了关键作用。此外，2009年，与首尔市政府和六家相关企业共同，建国大学与Fraunhofer ISE下一代太阳能电池研究中心（KFnSC）创建了一个连接地方政府、产业、学术界和研究的模式，为太阳能行业带来了新的增长引擎。同时，该系还在进行研究，以加速实现清洁能源社会的物质化。