建国大学数学系的研究生项目包括13位教授，专注于代数、解释学、几何、拓扑以及组合和应用数学领域的研究。该系重点专注于与几何和应用数学相关的领域，并参与由韩国教育科学技术部监督的项目，旨在培养研究生院和研究团队。这些项目包括数学领域的核心项目BK21，即“大脑韩国21世纪计划”和第二阶段和BRL（基础研究实验室）。

建国大学数学系的研究生课程涵盖微分几何、代数几何、复杂几何和几何拓扑等与几何相关的领域，以及数值分析和生物数学等应用数学领域的研究。此外，该系教师积极从事复杂数学研究。由9位教授组成的生物数学和几何建模团队（6位几何学领域教授和3位应用数学领域教授）被选为BK21第二阶段的主要数学领域项目团队，致力于进一步发展研究生教育。该团队在第二和第三年度评估中取得了该领域的最高分。此外，由3位几何领域教授组成的流形带结构实验室，因2009年被韩国国家研究基金会选为BRL项目数学领域的唯一团队，正成为韩国几何研究的核心团队之一。

自2007年与亚利桑那州立大学的数学和理论生物学研究所（MBTI）签署合作备忘录以来，建国大学数学系研究生院在国际交流与合作方面一直很活跃。该系每年派遣研究生参加MBTI的暑期研究项目。

数学是通过科学的语言理解自然规律的最重要手段。近年来，数学还对工程学、经济学和自然科学等学术领域做出了重大贡献。为应对这些趋势，建国大学数学系的成立目标是培养能够使用数学解决现代技术社会复杂问题的能力、具备数学创造力和推理能力的数学专家。我们的讲座结合了纯数学和应用数学，包括代数、解释学、几何、拓扑、数值分析和计算机。